医用消毒液洁净车间一般采用十万级净化标准，对于医用消毒液洁净车间的工作原理：气流—初效过滤器净化—空调—中效过滤器净化—净化风柜送风—送风管道—高效送风口—吹入洁净室—带走尘埃细菌等颗粒—回风百叶窗—初效过滤器净化。
对于医用消毒液洁净车间中的洁净空调系统风管一般采用镀锌钢板加工，镀锌钢板应选用优质板，且应镀层均匀、无起壳、无氧化；吊架、加固框、连接螺栓、风管法兰、铆钉均应采用镀锌件，法兰垫料应采用有弹性、不产尘、有一定强度的软橡胶或者乳胶海绵，风管的外保温可采用难燃PE板，以专用胶粘贴，不得使用玻璃棉等纤维制品。建筑围护结构和装修材料选用气密性良好，且不易发生形变的洁净板材料；内壁的表面要光滑、平整、不起尘、减少凹凸面；洁净室地面应平整，耐磨、易清洗，不易积聚静电，避免眩光，不开裂等；照明灯具应使用洁净灯具。
保证洁净车间的洁净度还要使用一些辅助设备，如洁净车间入口风淋室，物品传递使用专用传递窗等，物品进入使用货淋室等；为保证洁净车间的洁净度，密封一定要强，这样才能防止外面污染气流进入车间内，洁净车间里必须保持一定的正压。
